《北京晨報》報導，故宮大修的三個階段：到２００５年故宮博物院８０年院慶前，將基本完成包括故宮午門、欽安殿等中軸線周邊古建的大修工作；到２００８年北京舉辦奧運會時，完成對中軸路主殿如太和殿、乾清宮以及東西六宮等古建群的修繕；到２０２０年，故宮迎來紫禁城落成６００週年慶典時，大修工程全部完畢。
不過，由於大修工程面臨材料缺乏、工藝失傳、專業人才緊缺這三大難題，成為故宮大修順利進行的掣肘。
故宮內必不可少的「金磚」是此次大修工程中的難點，因為當年的金磚燒制技術和材料都已失傳，就連晚清時期的金磚，現在都已經很難燒出，主要是現在的土質性能和工藝燒制過程達不到標準。「準確地說，此次大修中故宮使用的僅是『仿金磚』或『精製澄泥磚』，這是時代造就的遺憾。」故宮的一位專家如是說。
宮廷彩畫材料也是一大難題，因為當年的彩畫顏料均為礦物質，而現今則為化學材質，這可能會出現三五年後就變色的情況，但卻是毫無辦法的事情。
此外，對木材的選擇也有遺憾，因為現在已經不可能再找到當年建築使用的大徑金絲楠木，如果有的話國家也明令禁伐。因此，故宮大修工程不得不用紅松、黃松等替代或者將舊木通過「拼接」、「包鑲」等方式代替。
而人才的斷檔、古建修繕多項技術面臨失傳也是困擾，現在許多掌握豐富維修經驗的老工匠已經辭世，而許多年輕的技術工人並不具備全套經驗。
琉璃瓦的復釉技術也是困擾工匠們的一個難題，因為現在的琉璃瓦燒制及挂釉技術絕不可能與當年相比，於是大修工程採用了部分使用新瓦、部分用舊瓦、舊瓦採用復釉燒制的技術。進行復釉舊瓦的標準是－－釉面脫落達５０％以上的才能進行重燒。
此外，另一個潛在的問題是，新瓦和舊瓦的釉色難以統一，壽命長短也不一致，新瓦的胎質也遠不及舊瓦，這使今後故宮的金黃色琉璃瓦有可能會出現斑駁不齊等偏差。
為了準備今次大修，故宮提前兩年進行備料，確保採購的木料在投入使用時乾燥，避免今後開裂、變形，確保材質穩定。在金箔的選擇準備方面，故宮專門訂製，而且超過了國家金箔厚度。
始建於明永樂四年（公元１４０６年）的故宮，是世界上現存最大最完整的古建築群，由於火災、大氣污染、酸雨等因素，故宮面臨著生存問題。故宮自新中國成立以來，陸續進行了６００多項大大小小的保護性修繕工作。而從２００２年開始的故宮大修計畫，將是自１９１１年辛亥革命以來，規模最大、範圍最廣、時間最長的一次。
