國際聲望高 才能突破外交困境
李遠哲強調，臺灣當前外交處境非常困難，跟很多國家都沒有邦交，中研院長若沒有相當高的國際聲望，很難代表臺灣走出去，在很多場合也難以得到尊敬。
李遠哲指出，中研院分成人文社會、數理科學和生命科學三大領域，新任院長應該要有全面的視野和遠見，關心照顧到各領域的進展，若新院長專長是數理或人文，更不能忽略生命科學是國際競爭最激烈的領域，必須好好推動生技研發，以免臺灣落後他國。
判事精準 視野兼顧各學術領域
在行政領導方面，李遠哲說他回臺前並未真正當過行政主管，接掌中研院前曾在美國請教過很多當過大學校長和學術機構主管的長
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