1989年，李鵬推波助瀾，積極參與鎮壓學生運動，雙手沾滿鮮血，被稱為"六四劊子手"，在鄧小平和楊尚昆死後，他成為頭號責任者，海內外一直要求追究他的罪行。在中共黨內，李鵬試圖開脫自己"六四"罪責的努力也受到阻撓。李鵬的日記系列已經出版了人大、外事、電力方面，但就是不能出版有關"六四"的那部分。
三峽工程是李鵬在國務院總理任內力主上馬的工程，近年來暴露出越來越嚴重的問題，被稱為"災壩"。據媒體報導，三峽庫區現在地震頻繁發生，各類崩塌與山體滑坡高達4000餘處；長江整體生態循環系統遭受嚴重破壞，不少區位發生嚴重污染，累計污染帶高達600 公里，而且趨勢還在增加。
2006年5月20日三峽大壩封頂的慶賀典禮上，中國最高領導層引人注目地無人出席，當年截流時的風光已不復存在。三峽工程搞成現在這個樣子，李鵬所受壓力之 大可想而知。最近在"兩會"上，10餘名由水利專家、環保專家組成的提案小組提出三峽工程生態與社會後果檢討的提案。
除了三峽工程外，由李鵬的親屬汪定國掌控的湖北清江水電開發工程，現已遭否定。這項工程曾被吹成是李鵬"德政"。然而，隨著汪定國在對外投資與擔保中有受賄行為曝光後，中紀委派人調查，在溫家寶和吳儀的大力支持下，湖北能源集團已將清江水電工程拿下，全歸湖北地方管理，將李氏勢力排除在外。
李鵬的鐵桿親信、前國家電力公司董事長高嚴出逃，揭開了電力系統腐敗的一角。在李鵬腐敗集團中，他的兒子李小鵬穩坐亞洲最大的發電企業--中國華能集團的第一把交椅，而該集團的代表人物是李鵬的女兒李小琳。2008年1月初，李小琳出任中國電力公司的董事長，成為中國的"電力大姐大"。而在此前，李小琳一直任中國國際電力投資公司的首席執行官。
據外界指稱，國際電投是李氏家族大批轉移國資的最重要管道。李家僅僅在2007年一年之內就轉移了1600億人民幣的資產，約合200億美元之多，主要轉移到紐西蘭、百慕大群島兩地。李小琳還曾與汪定國大搞私下交易，欲將整個清江水電開發系統轉投到國際電投旗下。與此同時，李家腐敗集團控制下的華能國際集團公開地對三峽大壩公路實行強行的壟斷收費並獨佔旅遊資源。
坊間傳聞，去年底，獲知副總理吳儀準備去華能集團的北京熱電廠去視察，為的是保證北京地區的供電不出問題，李鵬很高興吳儀能夠視察自己的領地，但詢問行期時，吳儀卻不置可否，聲言"行程未定"。隨後，吳儀沒有去北京熱電廠，而是去了中電投下屬的南昌熱電廠。吳儀這一不買賬的舉動讓李鵬大丟面子，李鵬頓時昏厥。
