南(北)朝劉宋元嘉二十年(公元443年)，太醫令秦承祖奏准創建醫學教育機構教授學生，同時還設立了太醫博士、太醫助教等醫官。到了公元6世紀的隋朝，創立了"太醫署'這樣一個機構，主要是一些太醫們集中在一起辦公的地方，相當於現在的醫學教育行政機構。隋"太醫署"直屬太常寺領導。"太常寺"是掌管當時禮樂、郊廟、社稷等一些事的。隋"太醫署"有主藥2人，醫師200人，藥園師2人，醫博士2人，助教2人，按摩博士2人，咒禁博士2人。但是隋"太醫署"的規模不大，設置不全，所以只能算是醫學校的初級階段，並不能算正規的醫學校。
我國第一座由國家舉辦的正式醫學專科學校是唐高祖武德七年(公元624年)，在長安建立的唐"太醫署"。唐"太醫署"由行政、教學、醫療、藥工四大部分組成，與現在醫學院(校)的教育行政機構設置相類似。
唐"太醫署"由皇家直屬。設太醫令2人，是"太醫署"的最高行政官員，相當於現在醫學院(校)的校長職務；還設立太醫丞2人，他們是作太醫令的助手。太醫丞手下則有醫監4人，醫正8人。以上18人都是"太醫署"的行政長官。
"太醫署"分醫學部和藥學部，就像現在醫學院（校）分醫學系和藥學系差不多。醫學又分四大科：醫科、針科、按摩科（包括傷科）和咒禁科，這與現在醫學系中設置的一些專業差不多。四科之中，醫科最大，總共有164人。
其中醫師20人，醫工100人，醫生40人，典藥2人，醫博士1人，醫助教1人。學生入學後，必須先學《素問》、《神農本草經》、《脈經》、《甲乙經》等基礎課程，然後再分專業學習。學生都由"太醫署"中的博士、助教教課，分專業學習為"一日體療，二日瘡腫，三曰少小，四日耳目口齒，五日角法"。每二十人中"十一人學體療，三人學瘡腫，三人學少小，二人學耳目口齒，一人學角法"。當時還規定學習年限："體療者七年成，少小及瘡腫五年，耳目口齒之疾並角法二年成。"實際上體療相當於內科，少小為小兒科，瘡腫為外科，耳目口齒為五官科，角法是一種外治方法。 其他三科中，針科共有師生員工52人，其中博士1人，助教1人，針師10人，針工30人，學生20人。針科學生先學醫學基礎理論，然後重點學習針灸專科。按摩科共有師生員工36人，其中博士1人、按摩師4人、按摩工16人、學生15人，以學習按摩專門技術為主。咒禁科共有師生員工21人，其中博士1人、咒禁師2人，咒禁工8人，學生10人，主要學習道禁和佛教中的五禁．但該專業人數最少，影響最小。
"太醫署"規定學生除了入學考試以外，月、季、年都有考試。對於學習9年仍不及格者，即令退學。而對於考試成績優良的，予以獎勵。這樣的考試制度保證了學生的質量，並且可以及時發現人材。太醫署不僅規定對學生定期考核，而且"凡醫師、醫正、醫工，療人疾病，以其痊多少而書之以為考課"。對於教師和教輔人員的考核制度保證了師資隊伍的質量，這樣也保證了整個醫學校的教育質量。
藥學部雖然沒有醫學部大，但也有一定規模。藥學部包括"府二人，史四人，主藥八人，藥童二十四人，藥園師二人，藥園生八人"。藥學部還設有藥園，所以當時不僅從理論上，還通過實踐培養藥學專門人材。 由於唐代對藥學較為重視，就為我國第一部藥典--《新修本草》的問世作好了準備。
我國第一所醫學校--唐"太醫署"為我國唐代培養了不少醫學人材，以後歷代都設立類似唐"太醫署"的醫學校。公元1102年，宋代，把醫學校劃歸"國子監"管理。"國子監"是當時主管教育的高級領導機構。宋代醫學校的規模也有了擴大。元、明、清幾個朝代的醫學校都與唐"太醫署"相類似，改變不大。歷代不少名醫都來自醫學校，如宋代朱肱、陳自明，元代危亦林、齊德之，明代徐春甫、薛己等。
世界各國紛紛學習我國唐"太醫署"這種醫學校的形式，辦起了一些類似醫學校形式的機構。如朝鮮在稍後仿唐"太醫署"設立博土，用中國醫書《素問》、《難經》、《甲乙經》、《本草經》等教授醫學生，日本在公元701年制定"大室律令"，設置了類似唐"太醫署"的醫學教育設置，同時規定學生必須以中國醫書《素問》、《新修本草》等做教科書。但這些醫學校的規模、範圍、形式都還不能正式列入醫學校。世界上所謂最早的醫學校是薩勒諾醫學校，在11世紀成立的。這所醫學校不但年代比唐"太醫署"晚了500多年，而且它的組織，規模等方面也差得多。
