据美国国家广播公司报道，美国情报人员透露，警方已在波士顿洛根机场的停车库发现了嫌疑犯遗弃的一辆小汽车。联邦调查局官员几乎可以肯定，有至少5名恐怖分子就是乘坐这辆汽车来到机场的。9月11日，从这里起飞的两架客机遭劫持，分别撞击了世贸中心的两座姊妹楼，造成了史无前例的人员伤亡。
联邦调查局通过机场设置的监视器画面发现，小汽车上的5名乘客“很明显”是阿拉伯人。警方还在小汽车内发现了航班信息手册和其他资料。调查人员从洛根机场的乘客登记册上发现，一名可疑的恐怖分子是从美国北部的缅因州飞到波士顿同其他恐怖分子会合的。
中央情报局人员还发现，其中2名恐怖分子持有“阿拉伯联合酋长国”的护照。
在美国南部佛罗里达州，联邦调查局正在搜查布罗沃特县的一处住宅。该建筑位于海边的一个叫Daytona的海滨。劫持飞机的恐怖分子曾居住在这座房子里。
联邦调查局高级官员们在接受美国国家广播公司记者采访时声称，调查人员们“百分之九十地肯定”本·拉登可能是这一系列恐怖事件的幕后策划者。但9月12日，巴基斯坦一家名叫Khabrain的报纸发表了本·拉登的声明。本·拉登说：“恐怖行动是一些美国组织的所作所为，我与此事没有任何关系。”
曾在美国前总统克林顿政府任职的2名高级反恐怖专家告诉美国国家广播公司，只有本·拉登旗下的遍布全球的“准军事恐怖网”才有“能力和动机”在美国发动这样大规模的袭击行动。
美国爱达荷州立大学反恐怖专家希恩·安德森教授在接受采访时称，他“百分之九十九点五地肯定”本·拉登组织是袭击的幕后策划。
阿富汗塔利班当局在9月11日美国恐怖袭击发生后发表声明指出，阿富汗和本·拉登与此事没有牵连。
9月12日，塔利班当局再次发表正式声明称，如果美国调查者能出具确凿的证据证明本·拉登与恐怖袭击事件有牵连，阿富汗将考虑将本·拉登引渡到美国。
