在一六八三年之前的台湾历史，虽有福建住民的来往，但可资记载之事，仅两条，即一六二二年荷兰人的占领与一六六一年郑成功退据台湾，建立抗清政权。大陆之中央政府从未对台进行过设制、派员、驻军的管治。因此，台湾学者质疑施琅攻台，不能说是康熙“统一”或“收复”台湾，因为以前从未统一过。
康熙雍正直言台自古未属中国
学者引证康熙帝在攻占台湾后，还说“台湾是海外地方，无甚关系。”“台湾乃海岸岛屿，今虽荡平，与闽省版图原无关涉。”甚至继位的雍正帝也谕旨：“台湾地方自古未属中国。”后来（一七八六年）乾隆帝也承认：“台湾地方自康熙年间始隶属版图”。（见二○○二年一月十日中国时报）中国最高统治者如是说，是有权威性的。
因此从历史看，台湾属于中国领土，最多可以推至施琅攻台前二十二年之郑成功打败荷兰人占领台湾，虽然，郑家政权不属清政府，但仍可视为中国明朝政府的余脉伸。施琅攻台成功，设府驻军，成为中国中央政权的隶属地区（知府），无疑是台湾历史上的大事。
据正史所载，康熙攻台，原意不在扩大版图，而是台湾有一个割据一方的反清政权，亦称“东宁国”，必须除掉这个隐患。开始因无能为力，甚至对台湾只是采取“迁界禁海”的封锁政策。后来郑成功死后，台湾郑氏家族发生火并，康熙才开始向台湾政权实行“招抚”，但数次谈判均被郑成功后人拒绝，台方坚持“藩国”待遇，“不剃发，不登岸，照朝鲜例入贡。”康熙被迫一再放宽招抚条件，但台方仍不屈从。
直至平定三藩之乱后，康熙才决定武力攻台。先于一六八○年攻占金门与厦门，一六八二年台湾郑成功之孙郑克爽继位，才十二岁，康熙趁此“主幼国虚”下达了攻取澎湖、台湾的命令。即使皇上有令，朝廷百官中仍有不同意见，反对武力攻台的人不少，认为台湾“海洋险远，断不可取”。
施琅大败郑军于澎湖，台乃归顺
这时，康熙才任命施琅挂帅攻台。施琅是福建晋江人，曾任福建水师提督，后投郑成功抗清，善于海战。康熙查得施琅二子七十三名亲属，在台因叛逆被郑氏全部杀掉，获得信任、并授予“独立专任”的攻台指挥权。
台湾政权听闻施琅统兵攻台，甚为紧张。郑克爽命大将刘国轩率二万兵力，二百战船坚守澎湖，一六八三年（康熙二十二年）六月，经过两次激战，施琅终以五船围攻一船的战术，大败郑军。郑军死万余人，五千人投降，毁战船二百余艘，清军亦死伤数百人。
台湾郑氏政权失守澎湖后，军心动摇，终于在施琅军事压力下，接受清廷的招抚条件，同意高级官员剃发，上京居住。翌年，完成“纳土归诚”，康熙帝授郑克爽一等公爵，拨田地房产，对投诚的二千文武官员及四万兵士，均作妥善安置。并下诏为郑成功父子摘“乱臣贼子”之帽。施琅则授予靖海将军，封侯嘉奖。康熙就这样恩威并施地“统一”台湾，瓦解了反清的郑氏政权。把台湾官员与军队一锅端地收编至大陆，康熙谕旨保证对他们“尽行赦免，加恩安插”，“朕不食言”。
清朝廷对台湾弃留的争论
至此，台湾问题已告解决，但清廷文武大臣中仍有一场“台湾弃留”的激烈争论。一派主张“迁其人，弃其地”，认为台湾是“海外丸泥，不足为中国加广”，只留澎湖为屏障即可。甚至原主张收复台湾的大学士李光地也主张将台湾放弃，因为远离大陆，不便管理，不如让给荷兰人，让他们世守纳贡，乃是永逸长安之策。（可见康熙治下还有“言论自由”）。
施琅及福建总督姚启圣却坚决反对放弃台湾，向上呈奏，康熙反复征求意见后，同意“留守台湾”，并当面批评了李光地。乃于一六八四年四月下令在台湾设立新的政权机构，改郑氏东宁府为台湾府，直辖澎湖，下设三县。府县官员由福建总督与巡抚委派，批准汉军旗人蒋毓英为台湾首任知府（官阶在省县之间）。康熙又依施琅建议，在台湾驻兵，台澎总计兵力一万名（台湾八千）。又亲选杨文魁为台湾首
任总兵官。
台湾学者质疑施琅谋台为己名利
以上资料参阅北京军方出版社一九九一年出版的中国历代名将丛书《康熙》。该书对施琅攻台所述较详，而周一良主编的《清朝简史》，对康熙攻台只有四行字的叙述。大陆研究施琅最热是一九九六年台湾总统大选之后，该年中共对台文攻武吓达到高潮，泉州厦门相继成立施琅研究会，福建各地建纪念馆，施琅与国家统一研讨会则无一年无之，规模之大动辄数百人。施琅被捧到超过郑成功民族英雄的高度。近期的电视剧《康熙王朝》中的施琅描写，比之上述学术活动则要轻率许多，史实错误接二连三。
台湾学者赖福顺指出，施琅攻占台湾之后，还两次向康熙上奏曰：“台湾一地原属海外，土番杂处，未入版图。”“臣窃见此地自天地开辟以来，未入版图。”说明“台湾自古以来是中国领土”之说全无根据。而施琅谋台另有所图，实为自己谋名利。赖教授指施琅在台湾搜括田地、港口收费所累财富，已是台湾史上最大的贪污案，其不法侵占长达二百年。四百年来台湾人对施琅的愤懑，是大陆人完全不知道的，台湾人尊崇郑成功是“开台圣王”，神主牌所在多有，施琅则只在澎湖一祠堂受到祭祀。
总之，这段历史清楚表明，台湾是在康熙年间才正式纳入中国版图，迄今不过三百二十年，由于中国传统的大陆锁国概念，攻台之战不同于征服三藩、噶尔丹、西藏及抗击沙俄，既非守土安疆，亦非扩张领土，如果没有郑成功政权的抗清复明活动，清廷未必有“统一”意愿。而早施琅攻台二十年之郑成功击败荷兰占领台湾，也只是为了建立一个反清基地。迄今亦仅三百四十年。
一八九五年马关条约，清廷将台湾割让日本以来，台湾与中国大陆分裂分治又超过了一百年，今日台湾问题的解决，乞灵于康熙施琅的攻台成功，大加渲染，恐怕并非善策，因为今天时空条件已经大大不同于康熙时代。
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