疾管局副局长施文仪表示，经初步调查发现，该校厕所及其洗手台之水源由地下水供应，感染源可能来自于缺乏加氯消毒的设备，导致地下水已遭受化粪池的污染，因此研判此次校内爆发群聚痢疾感染事件恐为使用不洁水源导致共同感染所致。
施文仪指出，爆发这起大规模痢疾群聚感染，源头可能来自于北屯国小一名小一女童，这名女童于3日发病，8日就医，研判可能于假日回南投时遭感染，加上校内的化粪池龟裂，导致使用水源受污染，才会爆发群聚感染事件。
目前疾管局已依传染病防治法第21条之规定，封闭校内的地下水源，并调拨1,200瓶消毒水给该校进行厕所及化粪池消毒，协调自来水公司载送清水供应北屯国小使用。
施文仪指出，杆菌性痢疾经由粪口传染，直接或间接食入被病人或带菌者粪便污染的食物或饮用水，就会造成感染。由于痢疾杆菌致病力很强，即使吃进10~100病菌即可能被感染。预防痢疾的最好方法，是保持水源干净、注重个人卫生，勤洗手，不生饮生食。
疾管局特别呼吁，北屯国小学童的家人、邻近社区的民众或曾前往该国小校园运动者，应留意若出现腹泻、发烧等杆菌性痢疾疑似症状时，应尽速就医，并主动告知与该校疫情的相关性。也提醒邻近医疗院所肠胃科、儿科、内科及家医科等医师提高警觉，发现疑似个案立即通报，以利提前采取预防措施。
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