中国大陆毒奶粉流入台湾一事，海峡两岸关系协会（海协会）今天（27日）发函台湾海峡交流基金会（海基会）正式表示对台湾民众的歉意，来函全文 147个字，内容如下：「三鹿牌不合格婴幼儿奶粉事件已被证实是一起不法分子制造的食品安全事件。对于由此给台湾消费者和厂商造成的困扰和损失，我会特请贵会转达对台湾民众的歉意。大陆方面绝不姑息任何伤害两岸消费者健康权益的不法分子，将继续秉持实事求是、认真负责的态度，采取坚决有效措施，严肃查处相关责任人，维护消费者健康权益。」
面对此一「迟来」的道歉，海基会董事长江丙坤表示，乐见海协会针对毒奶粉事件向台湾表达歉意。虽然时间上晚了一点，但他相信这一良性发展，对于即将在台北举行的第二次「江陈会谈」会有极为正面的帮助。海基会也已经正式成立申诉及求偿服务中心，受害的消费者与厂商所提出的申诉案件，海基会将透过海协会代为求偿。
台湾总统府发言人王郁琦说，针对台湾民众关切的毒奶粉事件，大陆方面能表示歉意，是一个善意的响应。行政院大陆委员会发言人刘德勋也表示，乐见大陆负责任的表现，但还要看大陆后续是否有负责任的行为，对该予以赔偿的给予赔偿。
而民进党国际事务部主任林成蔚表示，这样子的道歉太没有诚意，也太晚了，本来早就应该做的事，为什么要等到5、60万台湾人民上街头后，才用这种方式来处理。
台湾立法委员涂醒哲则质疑道歉避重就轻，全中国至少42家生产有毒的奶粉，这么严重而且广泛的现象，真正该检讨的是中国共产党这个政府，正是因为官方的姑息和讯息的拖延，才会造成广大民众的受害，甚至波及海外，「明明是政府和厂商挂钩做黑心生意，一旦发生了事情，都推给厂商。事实上，该被谴责是中国共产党政府，而不只厂商。」
国内毒奶事件爆发后，9月12日，海协会常务副会长郑立中罕见的以电话告知台湾海基会，三鹿公司生产的婴幼儿奶粉内含三聚氰胺，且有部分流入台湾。此事引起台湾民众强烈震撼，台湾陆委会于9月14日在记者会上要求大陆方面应立即道歉，并对受害商家与消费者予以赔偿。10月 25日台湾60万民众齐聚凯达格兰大道举行「反黑心顾台湾」的游行抗议活动。
