李宗仁（左）与毛泽东。（网络图片）
据台湾情报部门资料，“保密局”对中共威胁最大，1949年1月蒋介石下野后，李宗仁任代总统，立马精简了“保密局”，不仅任免了时任局长毛人凤外（改由副局长徐志道接任），也藉领导中央政府南迁至广州、再迁往四川成都之便，陆续将原本有数千人编制的保密局裁减至十来人。
“保密局”是在抗战胜利后改组的，保密局的前身是“军统局”，其首位领导为戴笠，而军统局的前身为“特务处”，机构首要任务便是搜集各地军阀情报，包括西北军阀杨虎城，无怪乎广西军阀出身的李宗仁任代总统后就先裁撤“保密局”。
国共内战期间，中共之所以能节节胜利，正是因为针对国军内部的策反与渗透成功所致，各地军阀不仅割据地方，国民党内的野心政客也早与中共密谋叛变。期间负责中共情报工作的周恩来就曾强调“只要阶级斗争存在一天，情报工作和安全工作就十分重要”、“要战胜敌人，非有情报工作不可”。
尽管正规编制遭到裁撤，但忠贞不屈的“保密局”仍在无编制、无经费亦无粮饷的窘境之下，仅靠数位同志的资遣费和友军（国防部“技术总队”和海军总部）余粮，坚持完成对中国大陆全国潜伏组织的布建后，才全员撤台；前后长达有一年半的时间。
“保密局”在国家存亡之际，也即时侦破中共在台内应组织“台湾省工委会”。1949年6月，吴石前往台湾任国防部参谋次长，成为中共的“密使一号”。1949年10月，“保密局”逮捕共产党台湾工委委员陈泽民。1950年3月，又逮捕几乎所有在台湾的中共党员400多名，其中就有吴石。1950年5月30日经中华民国法庭宣判吴石、朱谌之等4名涉案人员死刑。6月10日执行枪决的，据监狱官员口述，吴石对蒋公像三鞠躬，自语：“我对不起蒋委员长。”
立下大功并带领“保密局”众无名英雄的毛人凤受封为上将。
1950蒋中正总统在台湾复职后，同年6月才恢复“保密局”编制，立下大功并带领“保密局”众无名英雄的毛人凤受封为上将。
1955年4月，以毛泽东为首的中共首次提出“和平解放台湾”，并于当年度7月重申“愿意与台湾协商和平解放台湾的具体步骤”。1960年5月22日周恩来将毛泽东的意图具体落实为一纲(统一台湾)四目，其中的第四目为：“互约不派特务，不作破坏对方团结之事”。不过，毛泽东本人就曾亲自承认中共之所以在国军对日抗战8年后能够成功窃取政权，就是因为“隐蔽战线”成功渗透进中华民国政府党政军等各级枢纽机关，这也使得周恩来提出的一纲四目，尤其是第四目，分外显得讽刺，不是吗？
